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云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告

发布日期:2021-03-05 15:32:40 浏览次数:  文章字号:   

云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告

 

项目名称:云南中医药大学中药学院购置生物样品测序

服务

采购单位:云南中医药大学

项目预算:124776元

采购内容及要求:

一、资格要求

1.投标人须在中华人民共和国境内注册,且具备独立法人资格,提供营业执照(复印件加盖公章)。

2.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

3.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

     二、采购内容

 

项目分类

样本数量(例)

真核有参全转录组测序

24

DIA定量蛋白质组

24

非靶代谢组

28

 

 

三、检测要求

 

检测要求

蛋白质组学

检测内容

DIA定量蛋白质组学

检测要求

色谱分离后的样品用Q-Exactive HFX质谱仪(Thermo Scientific)进行DIA质谱分析

检测模式

正检测模式:正离子,一级质谱扫描范围:350-1650 m/z,质谱分辨率:60,000(@m/z 200),AGC target:3e6,Maximum IT:50 ms。MS2采用DIA数据采集模式,设置30个DIA采集窗口,质谱分辨率:30,000(@m/z 200),AGC target:3e6,Maximum IT:auto,MS2 Activation Type:HCD,Normalized collision energy:30,Spectral data type: profile。

数据分析

鉴定与定量结果统计、所有样本PCA分析、组间样本venn分析、差异结果数量统计、火山图分析、聚类分析、亚细胞定位分析、结构域分析、GO功能分析(GO功能注释分类、GO功能富集分析、 topGO有向无环分析)、KEGG通路分析(KEGG通路注释、KEGG通路富集分析、KEGG通路图展示)、互作网络及module分析、表型与组学关联分析、质控分析(色谱峰平均数据点、peak capacity分析、内标iRT保留时间分析、QC样本CV分布、QC样本PCA分布、QC样本相关性、样本定量强度分布、组间样本鉴定数量分布)。

代谢组学

检测内容

非靶代谢组学

检测要求

采用AB Triple TOF 6600 质谱仪进行样本一级、二级谱图的采集。TOF MS scan m/z range:60-1000 Da,product ion scan m/z range:25-1000 Da,TOF MS scan accumulation time 0.20 s/spectra, product ion scan accumulation time 0.05 s/spectra;二级质谱采用information dependent acquisition (IDA)获得,并且采用high sensitivity 模式。

数据分析

实验数据质量分析(QC样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析)、代谢物鉴定等级、代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计、单变量统计分析、多维统计分析(主成分分析、偏最小二乘判别分析、正交偏最小二乘判别分析)、筛选差异代谢物、聚类分析、相关性分析、KEGG通路注释与分析。

数据库

采用本地自建标准品数据库搜库,通过与本地数据库中代谢物的保留时间、分子质量(分子质量误差在<25 ppm内)、二级碎裂谱图、碰撞能等信息进行匹配,对生物样本中的代谢物进行结构鉴定,并对鉴定结果进行严格的人工二次核对、确认。鉴定等级在Level2以上。

 

 

 

转录组学

检测内容

转录组学

检测要求

Illumina测序平台

数据分析

样品间相关性评估、样本间主成分统计图展示、基因表达水平分析、样品基因表达量总体分布、基因差异表达分析、差异基因筛选、差异基因聚类、差异基因GO富集、top GO有向无环图分析、差异基因KEGG富集、KEGG富集散点图、差异基因蛋白互作网络分析、可变剪切事件分类和数量统计、差异可变剪切事件分类和数量统计、新基因挖掘、基因结构优化。

注意:

联合分析要求:联合分析需在同一平台完成,且不允许转包。

  

四、售后服务

 中标人需提供售后服务,数据返回后采购人会进行检测及联合分析服务质量的评估,一旦出现问题,中标人需保证24小时内服务响应,并于48小时以内给予处理办法;上门解答相关问题,讲解结题报告,协助进行思路挖掘;提供项目所有数据。数据保存6个月以上

五、报价材料要求

1.营业执照副本(复印件加盖公章)。

2.法定代表人身份证明书和法定代表人委托书原件(委托代理人投标加盖公章)。

3.报价人公司简介。

4.报价明细表。 

5.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

6.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

六、报价方式

请具有完成以上服务资质及能力的潜在报价人,将报价材料签字盖章并密封完好,于2021年3月11  日14:00-15:00期间,送至云南中医药大学资产处办公室(因学校处于疫情防控期间,可提前打电话联系后放门卫处),过时将不再接收。联系人:杨老师,联系电话:65918244、13759167276。

七、比价结果确定

采购人将根据报价人报送的报价文件,根据物美价廉的原则择优选定一家报价人为该项目成交人。

 

 

附件:报价明细表.xls               

                               云南中医药大学

                                 2021年3月5日

 

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