云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告
云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告
项目名称:云南中医药大学中药学院购置生物样品测序
服务
采购单位:云南中医药大学
项目预算:124776元
采购内容及要求:
一、资格要求
1.投标人须在中华人民共和国境内注册,且具备独立法人资格,提供营业执照(复印件加盖公章)。
2.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。
3.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。
二、采购内容
项目分类 |
样本数量(例) |
真核有参全转录组测序 |
24 |
DIA定量蛋白质组 |
24 |
非靶代谢组 |
28 |
三、检测要求
检测要求 |
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蛋白质组学 |
检测内容 |
DIA定量蛋白质组学 |
检测要求 |
色谱分离后的样品用Q-Exactive HFX质谱仪(Thermo Scientific)进行DIA质谱分析 |
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检测模式 |
正检测模式:正离子,一级质谱扫描范围:350-1650 m/z,质谱分辨率:60,000(@m/z 200),AGC target:3e6,Maximum IT:50 ms。MS2采用DIA数据采集模式,设置30个DIA采集窗口,质谱分辨率:30,000(@m/z 200),AGC target:3e6,Maximum IT:auto,MS2 Activation Type:HCD,Normalized collision energy:30,Spectral data type: profile。 |
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数据分析 |
鉴定与定量结果统计、所有样本PCA分析、组间样本venn分析、差异结果数量统计、火山图分析、聚类分析、亚细胞定位分析、结构域分析、GO功能分析(GO功能注释分类、GO功能富集分析、 topGO有向无环分析)、KEGG通路分析(KEGG通路注释、KEGG通路富集分析、KEGG通路图展示)、互作网络及module分析、表型与组学关联分析、质控分析(色谱峰平均数据点、peak capacity分析、内标iRT保留时间分析、QC样本CV分布、QC样本PCA分布、QC样本相关性、样本定量强度分布、组间样本鉴定数量分布)。 |
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代谢组学 |
检测内容 |
非靶代谢组学 |
检测要求 |
采用AB Triple TOF 6600 质谱仪进行样本一级、二级谱图的采集。TOF MS scan m/z range:60-1000 Da,product ion scan m/z range:25-1000 Da,TOF MS scan accumulation time 0.20 s/spectra, product ion scan accumulation time 0.05 s/spectra;二级质谱采用information dependent acquisition (IDA)获得,并且采用high sensitivity 模式。 |
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数据分析 |
实验数据质量分析(QC样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析)、代谢物鉴定等级、代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计、单变量统计分析、多维统计分析(主成分分析、偏最小二乘判别分析、正交偏最小二乘判别分析)、筛选差异代谢物、聚类分析、相关性分析、KEGG通路注释与分析。 |
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数据库 |
采用本地自建标准品数据库搜库,通过与本地数据库中代谢物的保留时间、分子质量(分子质量误差在<25 ppm内)、二级碎裂谱图、碰撞能等信息进行匹配,对生物样本中的代谢物进行结构鉴定,并对鉴定结果进行严格的人工二次核对、确认。鉴定等级在Level2以上。 |
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转录组学 |
检测内容 |
转录组学 |
检测要求 |
Illumina测序平台 |
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数据分析 |
样品间相关性评估、样本间主成分统计图展示、基因表达水平分析、样品基因表达量总体分布、基因差异表达分析、差异基因筛选、差异基因聚类、差异基因GO富集、top GO有向无环图分析、差异基因KEGG富集、KEGG富集散点图、差异基因蛋白互作网络分析、可变剪切事件分类和数量统计、差异可变剪切事件分类和数量统计、新基因挖掘、基因结构优化。 |
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注意: |
联合分析要求:联合分析需在同一平台完成,且不允许转包。 |
四、售后服务
中标人需提供售后服务,数据返回后采购人会进行检测及联合分析服务质量的评估,一旦出现问题,中标人需保证24小时内服务响应,并于48小时以内给予处理办法;上门解答相关问题,讲解结题报告,协助进行思路挖掘;提供项目所有数据。数据保存6个月以上
五、报价材料要求
1.营业执照副本(复印件加盖公章)。
2.法定代表人身份证明书和法定代表人委托书原件(委托代理人投标加盖公章)。
3.报价人公司简介。
4.报价明细表。
5.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。
6.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。
六、报价方式
请具有完成以上服务资质及能力的潜在报价人,将报价材料签字盖章并密封完好,于2021年3月11 日14:00-15:00期间,送至云南中医药大学资产处办公室(因学校处于疫情防控期间,可提前打电话联系后放门卫处),过时将不再接收。联系人:杨老师,联系电话:65918244、13759167276。
七、比价结果确定
采购人将根据报价人报送的报价文件,根据物美价廉的原则择优选定一家报价人为该项目成交人。
附件:报价明细表.xls
云南中医药大学
2021年3月5日
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